L’O.R.A. est fondée le 4 décembre 1942 par le général Frère qui regroupe parmi les militaires d’active ceux qui veulent reprendre le combat contre les Allemands. Le commandant Marielle Tréhoüart qui commande un bataillon du 151ème Régiment d’Infanterie cantonné dans le Jura, principalement à Lons, prend contact avec le général Frère en janvier 43, celui-ci lui confie immédiatement le commandement de l’O.R.A. du Jura. Même si elle reçoit un premier parachutage à Crançot la nuit du 14 au 15 avril 1943, ses actions sont limitées. La majeure partie des cadres du 151ème R.I. préfère suivre le commandant Foucaud, ancien chef d’Etat major du 151ème, qui en mai 1943 prend le commandement de l’Armée Secrète (A.S.) des M.U.R., aux forces nettement supérieures. La fusion entre les deux commandements se réalise en février 44, comme l’explique Marielle Tréhoüart : « Foucaud avait des Maquis, mais manquait de cadres, j’avais des cadres mais aucun maquis ».
L’union se révèle impossible entre les F.F.I. et les F.T.P., chacun voulant conserver son autonomie.